[백준🥈5] #1969 DNA (python)

1969번: DNA (acmicpc.net)

1969번: DNA

문제

DNA란 어떤 유전물질을 구성하는 분자이다. 이 DNA는 서로 다른 4가지의 뉴클레오티드로 이루어져 있다(Adenine, Thymine, Guanine, Cytosine). 우리는 어떤 DNA의 물질을 표현할 때, 이 DNA를 이루는 뉴클레오티드의 첫글자를 따서 표현한다. 만약에 Thymine-Adenine-Adenine-Cytosine-Thymine-Guanine-Cytosine-Cytosine-Guanine-Adenine-Thymine로 이루어진 DNA가 있다고 하면, “TAACTGCCGAT”로 표현할 수 있다. 그리고 Hamming Distance란 길이가 같은 두 DNA가 있을 때, 각 위치의 뉴클오티드 문자가 다른 것의 개수이다. 만약에 “AGCAT"와 ”GGAAT"는 첫 번째 글자와 세 번째 글자가 다르므로 Hamming Distance는 2이다.

우리가 할 일은 다음과 같다. N개의 길이 M인 DNA s1, s2, ..., sn가 주어져 있을 때 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA s를 구하는 것이다. 즉, s와 s1의 Hamming Distance + s와 s2의 Hamming Distance + s와 s3의 Hamming Distance ... 의 합이 최소가 된다는 의미이다.

입력

첫 줄에 DNA의 수 N과 문자열의 길이 M이 주어진다. 그리고 둘째 줄부터 N+1번째 줄까지 N개의 DNA가 주어진다. N은 1,000보다 작거나 같은 자연수이고, M은 50보다 작거나 같은 자연수이다.

출력

첫째 줄에 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA 를 출력하고, 둘째 줄에는 그 Hamming Distance의 합을 출력하시오. 그러한 DNA가 여러 개 있을 때에는 사전순으로 가장 앞서는 것을 출력한다.

예제 입력 1 

5 8
TATGATAC
TAAGCTAC
AAAGATCC
TGAGATAC
TAAGATGT

예제 출력 1 

TAAGATAC
7

예제 입력 2 

4 10
ACGTACGTAC
CCGTACGTAG
GCGTACGTAT
TCGTACGTAA

예제 출력 2 

ACGTACGTAA
6

 

✔️ Code

n, m = map(int, input().split())
DNA = []
for _ in range(n):
    DNA.append(input())
    
    
cnt = 0
result = ''
for i in range(m):
    count = [0, 0, 0, 0]  # A, C, G, T 개수
    for j in range(n):
        if DNA[j][i] == 'A':
            count[0] += 1
        elif DNA[j][i] == 'C':
            count[1] += 1
        elif DNA[j][i] == 'G':
             count[2] += 1
        elif DNA[j][i] == 'T':
            count[3] += 1
    idx = count.index(max(count))
    if idx == 0:
        result += 'A'
    elif idx == 1:
        result += 'C'
    elif idx == 2:
         result += 'G'
    elif idx == 3:
        result += 'T'
    cnt += n - max(count)

print(result)
print(cnt)

 

✏️ Comment

아래 그림을 보면 문제가 이해가 간다. 아래 그림에 나온 대로 코드를 짜면 되는데.. 쵸큼 어려웠다 ^^ 그래서 다른 분들의 풀이를 참고했다. 실버5라며 ㅠ ㅇ어렵군요.